„Sugar Sugar Rune” to bajka o dwóch czarownicach i przyjaciółkach z dzieciństwa, Chocolat Meilleure i Vanilla Mieux, które rywalizują ze sobą o tytuł następnej królowej Magicznego Świata! Aby wygrać, obie kandydatki muszą uczęszczać do szkoły w świecie ludzi, budując relacje mające na celu wydobycie serc przyjaźni i miłości ich kolegów z klasy. Ale czy śmierć czeka czarownicę, która odda swoje serce człowiekowi?
Razem z ich rycerzami, Chocolat i Vanilla podejmują się ochrony królestwa przed groźbą Ogrów, jednocześnie starając się stać się następną królową. Przygoda pełna przemian, tajemnicy, zazdrości i romansu czeka na widzów!