Po dramatycznych wydarzeniach w katedrze Kościoła Aksjomatu, Kirito pogrąża się w stanie głębokiej śpiączki, tracąc kontakt ze światem zewnętrznym. Tymczasem w wirtualnym „Underworld” zaczyna się wielka wojna. Królestwo Ludzi staje przed zagrożeniem ze strony sił Ciemnego Terytorium, które przygotowują zmasowaną inwazję. W obliczu konfliktu Alice przejmuje odpowiedzialność za obronę świata ludzi i musi wykazać się odwagą oraz determinacją, aby powstrzymać nadciągającą katastrofę. Podczas gdy granica pomiędzy rzeczywistością a wirtualnością zaciera się coraz bardziej, sojusznicy Kirito prowadzą desperacką walkę o przetrwanie świata, który może przesądzić nie tylko o losie mieszkańców Underworld, ale też o przyszłości całej ludzkości. Seria prezentuje emocjonującą akcję, filozoficzne rozważania o istocie świadomości oraz dramatyczną historię bohaterów walczących o najważniejsze wartości, takie jak przyjaźń, lojalność i poświęcenie.
