„Tenchi Muyou! in Love 2: Harukanaru Omoi” jest historią pełną tajemnic i niepewności. Gdy Tenchi, niespodziewanie zniknęł, zostawiając swoich przyjaciół zrozpaczonych, wszyscy zaczynają intensywne poszukiwania. Pół roku później, mimo braku jakiejkolwiek wskazówki na jego temat, przyjaciołom udaje się namierzyć Tenchi’ego. Wszystko wydaje się cieszyć, aż okaże się, że zapomniał o nich wszystkich i żyje teraz szczęśliwie z inną kobietą. Teraz muszą stawić czoła jeszcze większemu wyzwaniu – odzyskać wspomnienia Tenchi’ego i sprawić, aby wrócił do nich.