„Tokyo Ghoul” to mroczna opowieść o najazdzie na Tokio groźnych, ludzkożernych „ghouli”, które idealnie upodabniają się do ludzi i mieszają się z ich populacją. Spokojny student Ken Kaneki, zamiast śledzić wiadomości o narastającym kryzysie, skupia się na książkach. Jednak pojawienie się atrakcyjnej Rize Kamishiro burzy jego samotność, gdy ta bezceremonialnie proponuje mu randkę.
Po ciężkiej walce i tragicznych wydarzeniach, Kaneki budzi się w szpitalu, dowiadując się, że jego życie uratowano przez przeszczepienie organów zmarłej już Rize. Od tego momentu ciało Kanekiego przechodzi przerażające metamorfozy, zmieniając go w hybrydę człowieka i ghoul. W trakcie tej przerażającej podróży, Kaneki wciąż próbuje zachować swoją ludzką naturę w świetle krwawego konfliktu między nowymi potworami a rządowymi agentami, którzy ich polują.