W wigilijny wieczór, na pokrytych śniegiem ulicach Tokio trójka bezdomnych – żywiołowa młoda dziewczyna Miyuki, ekscentryczna osoba transpłciowa Hana oraz cyniczny, zgorzkniały Gin – odnajduje porzuconego niemowlaka wśród śmieci. Bohaterowie, poruszeni losem dziecka, decydują się znaleźć jego biologicznych rodziców, stawiając czoła własnym bolesnym wspomnieniom oraz niedopowiedzianym rozdziałom z przeszłości. Ich poszukiwania prowadzą ich przez zatłoczone, lecz samotne ulice Tokio, gdzie przeznaczenie oraz zbieg okoliczności mieszają się ze sobą w pełnych humoru, wzruszenia i najróżniejszych emocji momentach. Za pomocą charakterystycznego humoru oraz ciepłej, choć momentami gorzko-słodkiej atmosfery, „Tokyo Godfathers” ukazuje niezwykłą wartość rodziny, przyjaźni oraz nadziei, jaka potrafi narodzić się w najmniej oczekiwanych okolicznościach życia.