„Yamato Takeru” to sci-fi anime pełne przygód, które przenosi nas do 25. wieku. 300 osobowa załoga statku kosmicznego, po niespodziewanym wypadku, ląduje na planecie Ismo, znajdującej się w innym wszechświecie. Historia rozpoczyna się 12 lat po tym wydarzeniu. Ismo jest jedyną planeta pozostałą w systemie Onam, regularnie zagrażanym przez kometa Yomi. W centrum każdej z ośmiu planet ukryte są kamienie, w których zamknięty jest potężny potwór Yamatano Orochi. Kiedy zły bóg Tsukuyomi zniszczył siedem planet próbując zdobyć kamienie, ostatni został ukryty na Ismo. Teraz, milion lat później, gdy Yomi jest już blisko, Tsukuyomi planuje zdobyć ostatni kamień i zapanować nad wszechświatem. Jednak 13-letni chłopiec z Ziemi, Takeru, przypadkowo odkrywa Susanoo – najpotężniejszego z robotów bojowych i budzi go z milionoletniego snu. Takeru bierze udział w walce przeciwko Tsukuyomi, a Susanoo staje w obronie swoich przyjaciół i planety Ismo.