„Yoru no Kuni” to trzy różne historie, które łączy jeden wyjątkowy świat – świat nocy. W pierwszej z odsłon poznajemy Chiyo, małą dziewczynkę, która próbuje poradzić sobie ze śmiercią swojego ukochanego psa, Choco. Przewodnikiem Chiyo po krainie nocy jest Yoru – tajemnicza istota, która pomaga jej zrozumieć i zaakceptować stratę.
Druga historia opowiada o Hina i Tsumugi, które od dzieciństwa prowadziły wspólny pamiętnik. Gdy Hina chce podzielić się nim z nową przyjaciółką, zazdrosna Tsumugi wyrzuca pamiętnik. Budzi się wtedy w labiryncie świata nocy, gdzie musi zmierzyć się ze swoją samotnością.
Ostatnia historia to opowieść o Akatsuki, która ma trudności z budową kariery i identyfikacją swojej pasji do malarstwa. Odkrywa starą szkicownicę z listem od dawno nie widzianego przyjaciela, co staje się dla niej inspiracją i nadzieją na odzyskanie blaknącej pasji. Czy zdoła odnaleźć swoje miejsce w świecie sztuki?