„Fairy Tail: 100 Years Quest” to kolejny rozdział w życiu Natsu Dragneela i jego przyjaciół – Lucy Heartfilia, Gray Fullbuster, Erza Scarlet i Wendy Marvell, którzy wraz ze swoimi nadzwyczajnymi towarzyszami, Happy’m i Charlés’em, ruszają w niezwykle niebezpieczną misję. Rok po pokonaniu sił Acnologii i Zerefa, ekipa Fairy Tail przemierza kontynent Guiltina, aby podjąć wyzwanie, niewykonane przez ostatnie sto lat. Ich misją jest uwięzienie Pięciu Bogów Smoków – istot o potężnej mocy, które mogą spowodować globalną katastrofę. Tymczasem do gildii dołącza nowa, pełna energii członkini – Touka, która skrywa coś więcej niż się wydaje. Natsu i jego drużyna szybko odkrywają, że misja 100 Years Quest nie jest jedynym wyzwaniem, które będą musieli pokonać.