„Gatchaman” to anime osadzone w roku 2066, kiedy to Republika Hontworl opuszcza Organizację Narodów Zjednoczonych bez wyjaśnienia powodów, zagrażając bezpieczeństwu świata. Wkrótce po tym incydencie stolica Republiki Triad – miasto Myori zostaje zaatakowana przez latającą fortece w kształcie ptaka, znaną jako Turtle King. Międzynarodowa Organizacja Naukowa pod kierownictwem dr. Kouzaburou Nanbu zostaje powołana do rozwiązania tej tajemniczej kwestii. Jednocześnie czołowi naukowcy ISO znikają. Pięciu członków zespołu Science Ninja Team, czyli wojowników Gatchaman, zostaje wezwanych do sprawy. Czy Ken, znany także jako Orzeł, będzie w stanie ponownie poprowadzić swój zespół do zwycięstwa przeciwko tej nadzwyczajnej sile zła?