„Gibiate” to futurystyczna historia rozgrywająca się w Japonii w roku 2030, kiedy Ziemia jest zdominowana przez śmiertelną chorobę wirusową o nazwie „Gibia”. Wirus ten przekształca zarażone osoby w różnego rodzaju potwory, zależnie od wieku, płci i rasy. W tym niewyobrażalnym chaosie, samuraj i ninja z wczesnego okresu Edo podróżują razem w czasie, by pomóc profesorowi szukającemu lekarstwa na virus. Razem walczą z niezliczonymi potworami Gibia, bandytami i innymi groźnymi przeciwnikami w swojej misji ratowania ludzkości.