„Ginga Kikoutai Majestic Prince” to historia z drugiej połowy 21. wieku, kiedy ludzie opuszczają Ziemię, zaczynając żyć w kosmosie. Aby dostosować się do nowego środowiska i stawić czoła wrogim obcym z Jowisza, genetycznie zmodyfikowane dzieci zwane „Książętami” są sztucznie hodowane i szkolone, aby zostać pilotami zaawansowanych wielofunkcyjnych urządzeń bojowych „AHSMB”. Opowiadamy o jednym z nastoletnich „Książąt”, Izuru Hitachi, który uczy się w akademickim mieście Grandzehle.