W odległej przyszłości, gdzie zaawansowana technologia pozwala ludziom zastępować swoje ciała mechanicznymi częściami, młody chłopak o imieniu Tetsurou marzy o nieśmiertelności, by uniknąć nędzy i cierpienia ludzi żyjących w biedzie. Kluczem do spełnienia jego celu jest tajemniczy pociąg kosmiczny Galaxy Express 999, który przemierza galaktykę, zatrzymując się przy planetach o niepowtarzalnych, często mrocznych krajobrazach. Wraz z enigmatyczną kobietą o imieniu Maetel Tetsurou wyrusza w długą, pełną niebezpieczeństw podróż, poznając różnorodne kultury, filozofie i oblicza egzystencji. W trakcie swojej wyprawy chłopak zmierzy się z bolesnymi pytaniami o cenę nieśmiertelności, istotę człowieczeństwa oraz wartości, dla których naprawdę warto żyć. Pełnometrażowy film na podstawie klasycznej mangi autorstwa Leijiego Matsumoto urzeka klimatem melancholii, refleksji i poetyckim przedstawieniem bezkresnej przestrzeni kosmosu.
