Hikaru Shindou, zwyczajny chłopiec uczęszczający do nowoczesnej szkoły w Japonii, przypadkiem natrafia na tajemniczą, starą planszę do gry Go. Okazuje się, że plansza ta zamieszkiwana jest przez duch Sai, genialnego gracza Go z okresu Heian, który od dawna pragnie dalej doskonalić swoją grę poprzez Hikariego. Choć chłopiec początkowo nie wykazuje zainteresowania starożytną grą strategiczną, wciągnięty przez pasję Saia, stopniowo staje się coraz bardziej zafascynowany światem rozgrywek profesjonalnych graczy Go. Anime śledzi rozwój umiejętności i charakteru Hikariego oraz jego rywalizację z innymi utalentowanymi graczami, szczególnie młodym geniuszem Akirą Touyą. Dynamiczna fabuła, ciekawe osobowości i sportowe emocje sprawiają, że „Hikaru no Go” to historia pełna rywalizacji, przyjaźni i dorastania w dążeniu do pokonania własnych słabości i odnalezienia własnej ścieżki.
