Shuichi Nitori to wrażliwy uczeń szkoły podstawowej, który od najmłodszych lat zmaga się z dysforią płciową. Choć urodzony jako chłopiec, wewnętrznie czuje się dziewczynką i pragnie żyć zgodnie z prawdziwą tożsamością. Kiedy Shuichi poznaje Yoshino Takatsuki, koleżankę z klasy czującą się z kolei chłopcem uwięzionym w ciele dziewczyny, oboje znajdują w sobie wzajemne wsparcie i poczucie zrozumienia wobec własnych emocji. Hourou Musuko ukazuje ich codzienne życie, próby odnalezienia siebie w środowisku pełnym nieporozumień oraz konieczność poradzenia sobie z akceptacją społeczeństwa. Seria przedstawia delikatne problemy dorastania oraz budowania własnej tożsamości płciowej i interpersonalnej, zachowując subtelny, wnikliwy i pełen empatii ton.

