„Kaze no Stigma” opowiada o historii Kazumy Yagami, użytkownika „Fuujutsu”, czyli umiejętności sterowania wiatrem. Po czteroletnim wygnaniu z powodu niezdolności kontrolowania ognia i przegranej w pojedynku z młodszą kuzynką, Ayano Kannagi, wraca do rodzinnego domu. Jego powrót jest już dla rodziny problematyczny, ale sytuację komplikują niedawne morderstwa popełnione z użyciem Fuujutsu. Rodzina Kannagi, w tym porywcza Ayano, podejrzewa Kazumę o te zbrodnie. Teraz Kazuma musi nie tylko oczyścić swoje imię, ale także pomóc rodzinie, której nie darzy sympatią, by odnaleźć prawdziwego mordercę.