W roku 2307 ludzkość zwraca się ku energii słonecznej po wyczerpaniu tradycyjnych źródeł paliw, jednak dominacja trzech wielkich potęg sprawia, że świat nadal pogrąża się w konfliktach i wojnach. W odpowiedzi powstaje tajemnicza organizacja „Celestial Being”, wykorzystująca niezwykle zaawansowane mobilne pancerze zwane Gundamami. Jej celem jest bezkompromisowe zakończenie wszelkich konfliktów zbrojnych.
Głównym bohaterem jest Setsuna F. Seiei, młody pilot Gundama Exia i były dziecięcy żołnierz, który głęboko wierzy w walkę o pokój, lecz ciągle musi mierzyć się ze swoją bolesną przeszłością. Setsuna wraz z towarzyszami stają przed poważnymi moralnymi dylematami, obserwując, jak ich działania wpływają na złożoną sytuację polityczną świata.
Kidou Senshi Gundam 00 prezentuje realistyczną wizję przyszłości, pełną dramatycznych bitew, rozbudowanych postaci oraz poważnych refleksji nad istotą wojny, ludzkiej moralności i osobistych ideałów.
