Anime „Kud Wafter” to historia o Riki Naoe, który zmuszony jest do zamieszkania w niezbyt przytulnym klubie szkolnym, po tym jak był zmuszony opuścić męski akademik z powodu awarii. Na szczęście, nieśmiała Kudryavka „Kud” Noumi oferuje mu schronienie w swoim pokoju. Pomimo ciągłych docinek ze strony ich przyjaciół, Riki i Kud spędzają razem całe wakacje. Dzieląc niezapomniane doświadczenia, powoli zaczynają zdawać sobie sprawę, że ich przyjaźń może przerodzić się w coś więcej.