Anime „Magic Knight Rayearth II” to kontynuacja przygód Trzech Rycerzy Magii, którzy powracają do świata, który kiedyś ratowali. Po powrocie do domu, Hikaru Shidou, Umi Ryuuzaki i Fuu Hououji są nawiedzane przez koszmary związane z królestwem Cephiro, nie są w stanie zapomnieć o swoich wcześniejszych doświadczeniach. Kiedy spotykają się ponownie w wieży Tokyo, ich pragnienie powrotu do Cephiro staje się rzeczywistością. Mają za zadanie ponowne uratowanie królestwa, ale tym razem sytuacja jest inna. Cephiro jest teraz pustkowiem, pełnym potworów, a trzy narody próbują przejąć kontrolę nad królestwem. Czy uda im się przeciwstawić nowym przeciwnościom i ponownie przynieść pokój do Cephiro?