W magicznej krainie żyją dwie utalentowane i niezwykle energiczne siostry – Yoyo i Nene, które na co dzień zajmują się rzucaniem zaklęć oraz rozwiązywaniem niezwykłych, magicznych zagadek. Pewnego dnia, gdy młodsza Yoyo bada tajemnicze zjawisko, przypadek sprawia, że trafia do współczesnego świata ludzi, miejsca zupełnie obcego i pozbawionego magii. W nowym, zupełnie nieznanym środowisku dziewczyna, początkowo zafascynowana dziwnym stylem życia ludzi, staje przed zadaniem odnalezienia drogi powrotnej oraz zagadką tajemniczego zdarzenia łączącego oba światy. W międzyczasie druga siostra, Nene, zaczyna własne śledztwo mające na celu przywrócenie Yoyo do domu. Majokko Shimai no Yoyo to Nene to wesoła, pełna ciepła i magii historia opowiadająca o siostrzanych więzach, przyjaźni i odwadze w stawianiu czoła nieznanemu światu.

