„Monster Hunter Stories: Ride On” to opowieść z krainy, gdzie istnieją zarówno ludzie, jak i potwory. Tych, którzy polują na potwory, nazywa się Myśliwymi. W małym zakątku świata myśliwych istnieją jednak jeźdźcy – osoby, które tworzą silne więzi z potworami i żyją z nimi w harmonii. Za pomocą Kamieni Związku, które odkrywają ukrytą moc w potworach, jeźdźcy żyją w sekrecie wspólnie ze swoimi Otomon – potworami, z którymi stworzyli łączność.
Głównym bohaterem jest Ryuto – młody chłopiec z wioski jeźdźców Hakum, który marzy o zostaniu najlepszym jeźdzcem na świecie. Gdy kończy 12 lat, wyrusza w poszukiwanie swojego własnego Otomon przed ceremonią, na której otrzyma swój własny kamień związku. Razem z nim na tej wyprawie wyrusza jego dobroduszny przyjaciel z dzieciństwa Cheval, dociekliwa Lilia i partner Naville. Trafiają głęboko w las, gdzie spotykają rzadkiego Rathalosa.