„Märchen Mädchen” to historia Hazuki Kagimury, dziewczyny o nieokrzesanych umiejętnościach społecznych i braku przyjaciół. Unikając bólu rzeczywistości, Hazuki ucieka w świat widziany przez pryzmat jej wyobraźni, gdzie przeżywa przygody i nawiązuje przyjaźnie. Pewnego dnia, tajemniczy stary tekst pojawia się w jej torbie, prowadząc ją do ukrytej biblioteki, gdzie czeka na nią świat wyjęty z jej marzeń. „Märchen Mädchen” opowiada o spotkaniu Hazuki z Shizuką Tsuchimikado, jej pierwszą prawdziwą przyjaciółką, i odkryciu, że została wybrana przez pierwotną wersję „Kopciuszka” do zostania potężną czarodziejką. W Kuzunoha Girl’s Magic Academy, Hazuki uczy się przezwyciężać swoje lęki i uwierzyć w swoją zdolność do tworzenia niesamowitych historii.