„Persona 3 the Movie 1: Spring of Birth” to ekscytująca opowieść o groupie wybrańców, którzy posiadają tajemniczy dar – Persona. Podczas tajemniczej Godziny Ciemności, podczas której większość ludzi jest nieświadoma, oni walczą z groźnymi istotami zwanych Cieniami. Grupa ta, znana jako SEES (Specialny Szkolny Oddział Egzekucji), ma za zadanie odkryć przyczynę pojawienia się Godziny Ciemności. Niedługo po tym, jak przeniesiony student Makoto Yuuki zaczyna mieszkać w akademiku Iwatodai, jego Persona budzi się po ataku silnego Cienia. Dołącz do Makoto i jego towarzyszy w tej niezwykłej walce o ochronę ludzkości.