Planetarium Pokemon: Aurora kara no Message to historia o poszukiwaniu legendarnego Pokémona Suicune, który pojawia się, gdy słońce wchodzi w nowy cykl słoneczny. Satoshi i Gou, badacze z laboratorium Sakuragi, udają się do Wioski Aurory, by zbadać związek pomiędzy Suicune i aurorami. Na swojej drodze spotykają Emmę, córkę badacza zjawisk polarnych, oraz wiele Pokemónów żyjących na śnieżnych polach. Czy uda im się pokonać organizację Rocket-Dan, która próbuje zdobyć Pikachu, i spotkać się z Suicune przy świetle zorzy polarnej?