„Rurouni Kenshin: Meiji Kenkaku Romantan – Ishinshishi e no Chinkonka” to kontynuacja walki Kenshina Himury o pokoju po zakończeniu wojny przeciwko siogunatowi Tokugawy. Shigure Takimi, który stracił przyjaciół i rodzinę w imię wolności i dobrobytu, wraz z grupą rebeliantów zaprzysięgł zemstę. Staje do walki z Kenshinem, jednak po odkryciu jego prawdziwej tożsamości jako Hitokiri Battousai, jego walka przeradza się w osobistą vendettę.