W odległej przyszłości ludzkość rozprzestrzeniła się po całym wszechświecie, jednak podzielona została przez zażartą wojnę pomiędzy Unionem a Deague. Sara Werec marzy o zostaniu pilotem mecha typu Strain – zaawansowanej maszyny bojowej sterowanej przez połączonego mentalnie z jednostką operatora. Jej spokojne życie przerywa nagły atak starszego brata, Ralpha, który zdradza własny świat i staje się największym wrogiem Unii. Wstrząśnięta zdradą najbliższej osoby Sara postanawia odkryć prawdę stojącą za działaniem brata i przyczynami wojny, a także chronić niewinnych cierpiących w konflikcie. „Soukou no Strain” łączy dynamiczne pojedynki mechów z osobistym dramatem bohaterki, ukazując bolesną drogę ku dojrzałości w świecie ogarniętym chaosem wojny i zdrady.
