Kyuu marzy o zostaniu najlepszym detektywem na świecie, zainspirowany legendarnymi sukcesami słynnych śledczych. Aby spełnić swoje marzenie, chłopak zapisuje się do prestiżowej Akademii Detektywów Dan, elitarnej szkoły kształcącej młodych detektywów, którzy w przyszłości mają stanowić elitę rozwiązywania zagadek kryminalnych. Tam poznaje nowych przyjaciół, między innymi inteligentnego Megumiego, genialnego analityka Kazumę i tajemniczego, uzdolnionego Ryuu.
Pod okiem renomowanego detektywa Dana Morihiko grupa uczniów rozwiązuje trudne kryminalne zagadki wymagające sprytu, dedukcji oraz inteligencji. Szybko odkrywają jednak, że zło nie śpi, a ich przeciwnikami są nie tylko przestępcy, lecz także organizacja mogąca zagrażać ich bezpieczeństwu i przyszłości. Tantei Gakuen Q, utrzymane w lekko humorystycznym i przygodowym tonie, pełne jest dynamicznych śledztw, zwrotów akcji i tajemnic czekających na rozwikłanie.
