„Yowamushi Pedal: New Generation” opowiada o dalszych losach drużyny kolarskiej w liceum Sohoku. Po oszałamiającym sukcesie na krajowych zawodach Interhigh i pokonaniu dotychczasowych mistrzów z Akademii Hakone, drużyna musi stawić czoło nowym wyzwaniom. Trzeci rok nauki kończą Kinjou, Makishima, i Tadokoro, więc młodsi zawodnicy muszą podjąć się kontynuowania ich dziedzictwa. Pomimo zmian, nie zmienia się cel – obrona mistrzowskiego tytułu. Rywale nie pozostają w tyle, więc Sohoku muszą znowu udowodnić, że są najlepsi.