Cosplay City stoi w obliczu zagłady, gdy złowrogi Dolmeck i jego armia potworów rozpoczynają inwazję. Nadzieją na ratunek jest tylko jedna osoba — Honey Kisaragi, android zdolna do zmiany postaci, znana jako Cutey Honey. Po przebudzeniu z długiego uśpienia, Honey staje do walki, korzystając ze swych niezwykłych zdolności, aby przeciwstawić się Dolmeckowi i chronić mieszkańców miasta. Jednak nowa batalia ujawnia także starych wrogów — niespodziewanie na scenie pojawia się związana z przeszłością Honey złowroga Panther Zora.
„Shin Cutie Honey” to dynamiczna i utrzymana w klimacie science fiction opowieść akcji, która łączy motywy walki dobra ze złem, poświęcenia oraz odwagi. Główna bohaterka nieustannie balansuje pomiędzy rolą obrończyni a porachunkami z własną przeszłością, mierząc się z kolejnymi zagrożeniami w futurystycznej metropolii. Serial prezentuje barwną galerię postaci, widowiskowe przemiany i wartką akcję, zachowując nostalgiczny klimat klasycznych opowieści o superbohaterach.
