Yuu Otosaka pozornie wiedzie typowe życie zwyczajnego nastolatka – skrywa jednak niezwykły sekret, jakim jest zdolność tymczasowego przejęcia ciała innej osoby. Zdolność ta zwraca na niego uwagę tajemniczej dziewczyny o imieniu Nao Tomori, która sama posiada specjalne umiejętności oraz kieruje działalnością samorządu szkolnego w akademii Hoshinoumi. Placówka ta gromadzi uczniów z nadnaturalnymi mocami, stanowiąc dla nich schronienie i pomoc w poradzeniu sobie z konsekwencjami posiadania niezwykłych darów. Wciągnięty w nowy, niebezpieczny świat pełen tajemnic, Yuu zaczyna odkrywać prawdziwy zasięgi oraz mroczne konsekwencje posiadania wyjątkowych umiejętności. „Charlotte” to historia pełna emocji, humoru oraz dramatycznych zwrotów akcji, ukazująca młodych ludzi mierzących się z odpowiedzialnością, przyjaźnią oraz próbami własnego charakteru.

