„Chocolate Underground: Bokura no Chocolate Sensou” to przygoda osadzona w fikcyjnym współczesnym kraju, gdzie partia polityczna „Good for You” wprowadziła zakaz spożywania czekolady. Główni bohaterowie, Huntly i Smudger, są zwykłymi chłopcami, którzy zawsze uwielbiali słodycze. Odkąd wprowadzono nowe prawo, ich ukochany sklepik stał się pusty. Wszystko zmienia się, kiedy dowiadują się o istnieniu tajemniczego handlu czekoladą. Kiedy ich przyjaciel Div zostaje złapany przez Czekoladową Policję, postanawiają wyruszyć na własną nielegalną przygodę z czekoladą. Czy uda im się odzyskać „zabawną i piękną” rzeczywistość, którą kiedyś znały?