W alternatywnej rzeczywistości Clannad głównym bohaterem opowieści jest Tomoya Okazaki, który po raz kolejny boryka się ze szkolną codziennością i skomplikowanymi relacjami uczuciowymi. Tym razem ścieżki jego życia przecinają się z energiczną, lecz wrażliwą Kyou Fujibayashi, której uczucia wobec Tomoyi stają się coraz intensywniejsze. Sytuację dodatkowo komplikuje fakt, że Ryou, nieśmiała siostra bliźniaczka Kyou, również darzy Tomoyę uczuciem. Bohaterowie stają przed niełatwymi wyborami, gdzie przyjaźń miesza się z miłością, a jedna decyzja może nieodwracalnie zmienić ich życie. Seria ta, pełna emocji, nostalgii i subtelnego humoru, doskonale oddaje atmosferę szkolnego romansu, koncentrując się przy tym na konsekwencjach podejmowanych decyzji oraz na sile uczuć, które kształtują nasze przeznaczenie.
