Minął rok od dramatycznej Rebelii Czarnego Rycerza pod przywództwem Leloucha Lamperouge’a, genialnego młodego stratega posługującego się mocą Geass — niezwykłą zdolnością pozwalającą kontrolować wolę innych ludzi. Świat uważa Leloucha za martwego, a Imperium Brytyjskie umacnia swoją dominację nad Japonią, nazywaną teraz Strefą 11. Chociaż Lelouch pozornie prowadzi spokojne życie, wkrótce wydarzenia zmuszają go do powrotu na pole walki. Jego dawne pragnienie zemsty i dążenie do sprawiedliwości prowadzi do odrodzenia ruchu oporu. Drugi sezon kontynuuje pełną dramatyzmu historię Leloucha, ukazując jego wewnętrzną walkę z moralnością i ceną absolutnej władzy. W atmosferze politycznej intrygi, widowiskowych bitew oraz osobistych poświęceń młody rewolucjonista musi zdecydować, jak daleko posunie się, by osiągnąć upragniony cel.