Akcja rozgrywa się w niedalekiej przyszłości w Tokio, pogrążonym w chaosie z powodu szeregu bezlitosnych ataków terrorystycznych dokonywanych przez tajemniczą organizację Adonis. Miasto zostaje ogłoszone strefą kwarantanny, gdzie mieszkańcy zmuszeni są do życia pod nieustającą obserwacją i surowymi ograniczeniami. Główną bohaterką jest młoda policjantka Ichika Hoshino, która zostaje zaatakowana i budzi się z założoną na szyję obrożą o zabójczym mechanizmie. Zmuszona wkroczyć do niebezpiecznej gry z przestępcami, Ichika musi współpracować z czwórką enigmatycznych dochodzeniowców, aby ocalić życia niewinnych ludzi i odzyskać kontrolę nad własnym przeznaczeniem. „Collar×Malice -deep cover-” to psychologiczny thriller, pełen intensywnej akcji, zawiłej intrygi i napiętej atmosfery, w którym granice między dobrem a złem zaczynają się zacierać.
