Keitarou Gentouga posiada zdolność widzenia duchów, jednakże stara się unikać wszelkiego kontaktu z nadprzyrodzonym światem po traumatycznych przeżyciach w przeszłości. Jego życie drastycznie się zmienia, gdy podczas korepetycji poznaje Yayoi Houzuki—bardziej niezwykłą dziewczynkę obdarzoną nadludzkimi zdolnościami duchowej percepcji oraz niezwykle ponurą obsesją: zbieraniem złowrogich, niebezpiecznych duchów. Wbrew własnym obawom Keitarou zostaje wciągnięty przez Yayoi w serię mrocznych wydarzeń, pełnych grozy, zagadek i niebezpieczeństwa. Razem stawiają czoła coraz groźniejszym przeciwnikom ze świata duchowego, balansując na granicy życia i śmierci. „Dark Gathering” oferuje mieszankę atmosfery horroru, tajemniczości oraz czarnego humoru, a także opowiada o konfrontowaniu wewnętrznych traum i sile przyjaźni w obliczu paranormalnych zagrożeń.
