Świat cyfrowych potworów stanął wobec zagłady, gdy potężny komputer Yggdrasil postanawia oczyścić Digiświat z większości życia, aby go przebudować. Jedynie nieliczne Digimony, obdarzone czynnikiem X, są w stanie przetrwać tę katastrofę – jednak jako odmienne, obce istoty, szybko stają się celem dla lojalnych wobec Yggdrasila trzynastu Królewskich Rycerzy.

W tym pogrążonym w chaosie świecie poznajemy Digimona imieniem Dorumon, młodego i pełnego odwagi stworzenia noszącego tajemniczy czynnik X. Ścigany przez potężnych Rycerzy, Dorumon musi odkryć prawdę o swoim istnieniu i ocalić nie tylko swoje życie, ale również los całego Digiświata. „Digimon X-Evolution” to mroczna i przepełniona akcją opowieść o walce, przetrwaniu i odnajdywaniu własnej tożsamości w obliczu nieuniknionej katastrofy.