Minęło już trochę czasu od kiedy Takato i pozostali Tamerzy stoczyli ostateczną walkę, a życie w ich rodzinnym Tokio wróciło do normy. Jednak ta chwila spokoju szybko zostaje przerwana, gdy pojawia się tajemniczy Digimon – rozpędzony, niekontrolowany Locomon. Lokomotywa Digimon szaleńczo pędzi przez miasto, powodując chaos i stwarzając zagrożenie dla mieszkańców. Tamerzy muszą zjednoczyć siły ze swymi cyfrowymi partnerami, by zbadać przyczynę dziwnego zachowania Locomona i ocalić Tokio przed katastrofą. Wkrótce jednak okazuje się, że za problemem kryje się coś znacznie bardziej złowrogiego, niż początkowo sądzili. Bohaterowie stają przed kolejną trudną próbą, a czas staje się ich największym przeciwnikiem.

Pełen akcji, napięcia i nostalgicznego klimatu film „Digimon Tamers: Bousou Digimon Tokkyuu” koncentruje się na sile przyjaźni oraz pokonywaniu wyzwań, które wystawiają głównych bohaterów na kolejną wielką próbę.