Akcja Fate/Apocrypha rozgrywa się w równoległym świecie do wydarzeń znanych z Fate/stay night, gdzie Święty Graal został skradziony z Fuyuki City. Po wielu latach ród Yggdmillennia otwarcie odwraca się przeciwko Stowarzyszeniu Magów, uzyskując niezależność i ogłasza własne wyzwanie, rozpoczynając bezprecedensową wojnę dwóch drużyn po siedmiu Mistrzów. Bohaterem opowieści jest Sieg — niezwykły młodzieniec, którego los splata się ze spiskiem, wojownikami i legendarnymi heroicznymi duchami osobliwego konfliktu. Obok niego poznajemy Jeanne d’Arc, sługę powołaną przez Święty Graal jako neutralnego arbitra zmagań. W tej wojnie, nazywanej Wielką Wojną o Graala, bohaterowie nie tylko będą walczyć o spełnienie swoich marzeń i ambicji, lecz także staną przed trudnymi pytaniami dotyczącymi celu i istoty istnienia. Fate/Apocrypha oferuje dramatyczne pojedynki, mroczną atmosferę oraz filozoficzne rozważania, czyniąc ją obowiązkową pozycją dla miłośników uniwersum „Fate”.
