W odległej przyszłości Ziemia stała się światem, gdzie ludzkość i przyroda są sobie wrogo nastawione. Po katastrofie wywołanej przez nieudany eksperyment genetyczny, ogromne lasy rządzone przez świadomą roślinność zaczynają dominować nad światem. Młody chłopak Agito mieszka w Neutral City—jednym z nielicznych miejsc, gdzie ludzie próbują współistnieć z naturą. Pewnego dnia Agito odkrywa dziwną kapsułę ukrytą w ruinach przeszłości, w której śpi Toola, tajemnicza dziewczyna z minionych czasów. Jej przebudzenie burzy równowagę między ludźmi a potężnymi siłami natury. Agito, obdarzony niezwykłą mocą po kontakcie z lasem, postanawia ochronić Toolę i ich świat przed konfliktem, który może oznaczać koniec wszelkiego życia. „Giniro no Kami no Agito” to piękna wizualnie opowieść łącząca elementy science fiction z ekologicznym przesłaniem, o miłości, odwadze i walce o przetrwanie w niezwykłym świecie przyszłości.

