Po długiej i wyczerpującej bitwie ludzkie nadzieje na odzyskanie Ziemi z rąk potężnego monstrum, Godzilli, zdają się prawie całkowicie utracone. Haruo Sakaki, młody dowódca, wciąż nie poddaje się i pozostaje zdeterminowany, by skończyć epicki konflikt raz na zawsze. W decydującej chwili desperacji wyłania się ostatnia tajemnicza szansa – mityczna istota nazywana Ghidorą, kosmiczny stwór żywiący się planetami. Jednak czy ten nowy sojusznik faktycznie przyniesie ludziom upragnione zwycięstwo, czy może okaże się jeszcze większym zagrożeniem niż sam Godzilla?
Godzilla 3: Hoshi wo Kuu Mono stanowi ostatnią część animowanej trylogii utrzymanej w mrocznym, futurystycznym klimacie science fiction. Oprócz spektakularnej walki gigantycznych istot film koncentruje się na filozoficznych pytaniach o przetrwanie, naturę ludzkości oraz cenę, jaką bohaterowie muszą zapłacić za swoje decyzje.
