„Hitorigurashi no Shougakusei” to historia dziewięcioletniej Rin Suzune, która po śmierci rodziców mieszka sama i prowadzi rodzinny lokal gastronomiczny. Jako dziecko, Rin nie ma odpowiedniej wiedzy, by gotować smaczne dania czy prowadzić biznes, więc jej próby zarabiania pieniędzy kończą się niepowodzeniem. Situacja komplikuje się, kiedy w szkole jest dręczona z powodu biednego pochodzenia, ale Rin pozostaje nieugięta. Mimo ograniczeń w gotowaniu, lokal zyskuje sympatię mieszkańców okolicy, którzy z nadzieją niesą pomoc szczerej dziewczynie.