Świat już dawno zapomniał o potężnych Kaijuu – groźnych stworzeniach, które niegdyś siały chaos wszędzie, gdzie się pojawiły. Jednak ich esencja przetrwała w formie uroczych dziewcząt obdarzonych nadnaturalnymi mocami. Młoda dziewczyna, Agira, nagle odkrywa, że także ona posiada geny Kaijuu i wstępuje do specjalnej organizacji, której zadaniem jest trenowanie takich jak ona – dziewcząt będących ucieleśnieniami legendarnych potworów z serii Ultraman.
„Kaijuu Girls” opowiada o perypetiach grupy sympatycznych bohaterek, które chcą nauczyć się kontrolować swoje wyjątkowe moce i odnaleźć się w nowej rzeczywistości. W świecie pełnym humoru, zabawnych sytuacji oraz wzruszających momentów, Agira wraz z przyjaciółkami stawi czoła codziennym wyzwaniom i własnym słabościom, aby odkryć prawdziwe znaczenie przyjaźni, odpowiedzialności oraz własnej natury Kaijuu.
