Historia rozgrywa się w tajemniczym, opuszczonym świecie, pokrytym dziwnymi czerwonymi mgłami oraz roślinopodobnymi formami życia nazywanymi Kemurikusa. W centrum opowieści znajduje się grupa sióstr, które każdego dnia walczą o przetrwanie, przemierzając niebezpieczne ruiny w poszukiwaniu zasobów i nowych odpowiedzi na nurtujące tajemnice tego świata. Główną bohaterką jest Rin, młoda, zdecydowana dziewczyna, obdarzona niezwykłą siłą oraz umiejętnością manipulowania Kemurikusa. Kiedy na swojej drodze spotykają chłopaka o imieniu Wakaba, ich życie zaczyna się diametralnie zmieniać, a ich spojrzenie na rzeczywistość nabiera zupełnie nowych barw. „Kemurikusa” to anime o melancholijnym tonie, łączące dystopijny klimat z elementami tajemnicy i emocjonalnymi rozmyślaniami o istocie ludzkiej egzystencji.

