Rok 0079 Uniwersalnego Wieku. Wojna między Ziemską Federacją a Księstwem Zeonu wkracza w decydującą fazę. Po wielu trudach młody pilot Amuro Ray oraz załoga okrętu wojennego Biały Baza kierują się ku ostatecznej konfrontacji w przestrzeni kosmicznej. Amuro, uzdolniony pilot eksperymentalnego Mobile Suita RX-78 Gundam, musi zmierzyć się ze swoimi najgłębszymi obawami oraz potężnym przeciwnikiem—legendarnym asem Zeonu, Charem Aznable. Ich losy ponownie się splatają, podczas gdy obie strony konfliktu toczą dramatyczną walkę o przyszłość ludzkości. Trzecia część filmowej trylogii utrzymana jest w poważnym, dojrzałym tonie i stawia nacisk na relacje między bohaterami oraz konsekwencje wojny, prowadząc widza do emocjonującego finału pełnego napięcia i widowiskowych potyczek w kosmosie.