KILLTUBE to anime osadzone w roku 2026, kiedy Japonia kontynuuje swoją izolację pod rządami Sogunatu Edo. W tym rygorystycznym systemie społecznym, gdzie hierarchie są ściśle przestrzegane, trzech indywidualistów, uznawanych za „margines społeczeństwa”, spotyka się w więziennej celi, co prowadzi do ich nieuchronnego spotkania. Postanawiają dołączyć do platformy wideo związanej z pojedynkami o nazwie „KILLTUBE”, gdzie mają szansę zdobyć fortunę i odzyskać swoją wolność w świecie pełnym segregacji.
W tej erze, określanej jako „Wiek Wielkich Pojedynków”, można zdobyć ogromne bogactwa poprzez pokonywanie silnych. Bohaterowie stawiają czoła dyskryminacji ze strony samurajów i kupców dążących do władzy oraz autorytetu. Przełamując ograniczenia i zdobywając kolejne zwycięstwa, zdobywają popularność i stają się celebrytami swoich czasów. Jednak na szczycie swojej sławy odkrywają ukrytą prawdę dotyczącą „KILLTUBE”, która zmienia wszystko, co o tej platformie wiedzieli.