„Kimi no Iro” to historia licealistki z Nagasaki, Totsuko, która posiada niezwykły dar – potrafi widzieć uczucia ludzi jako „kolory”. Te kolory mogą być szczęśliwe, smutne, spokojne, przerażone… Dziewczyna zawsze stara się czytać nastroje i kłamać, aby ukryć prawdę i nie ciemnieć „koloru” bliskich. Pewnego dnia w antykwariacie na obrzeżach miasta Totsuko tworzy zespół muzyczny z dziewczyną o pięknych kolorach i chłopakiem, który kocha muzykę. Wtedy rozpoczyna się ich barwna młodość.