„Kiniro no Corda: Secondo Passo” kontynuuje opowieść po szkolnym konkursie muzycznym z pierwszej serii. Kahoko, rozwijająca swoje umiejętności muzyczne, spotyka surowego Etō, młodego dyrektora szkoły Akihiko Kirę oraz tajemniczego ucznia przeniesionego, Aoiego Kaji.