Koukaku Kidoutai: Stand Alone Complex 2nd GIG

„Koukaku Kidoutai: Stand Alone Complex 2nd GIG” to kontynuacja przygód Sekcji 9, elitarnej jednostki walczącej z cyberterrorystami. Po zamknięciu sprawy „Laughing Man”, nowo wybrana premier Japonii, Youko Kayabuki, ponownie powołuje do życia Sekcję 9. Grupa o nazwie „The Individual Eleven” zaczyna dokonywać aktów terroru na terenie całego kraju. Członkowie Sekcji 9, w tym Motoko Kusanagi, Daisuke Aramaki i Batou, próbują odnaleźć sprawców tych zbrodni. Równocześnie rząd Japonii zmaga się z kryzysem związanym z uchodźcami z Trzeciej Wojny Światowej, starającymi się o azyl. Kiedy ścieżki bohaterów zaczynają krzyżować się z Gouda Kazundo, czołowym członkiem Służby Wywiadowczej Gabinetu, zaczynają podejrzewać, że może on być zamieszany w te wydarzenia. Okazuje się, że kryzys uchodźczy i działania „The Individual Eleven” mogą być ze sobą ściśle powiązane…