Świat ogarnięty został zagładą, a pozostałości ludzkości znajdują schronienie w ufortyfikowanych osadach, nieustannie zagrożonych przez agresywne istoty zwane Kabane. W tych czasach, w których stale trzeba walczyć o przetrwanie, podróżuje opancerzony pociąg Koutetsujou, na pokładzie którego znajduje się młody Ikoma—człowiek-Kabaneri, próbujący znaleźć swoje miejsce pomiędzy dwoma światami. Tym razem jego grupa dociera do Unato, strategicznego punktu, gdzie trwa zaciekłe starcie z hordami Kabane. Podczas gdy mieszkańcy fortecy desperacko walczą o przetrwanie swojego domu, Ikoma i towarzysząca mu wojowniczka Mumei stają przed ciężką próbą lojalności, odwagi oraz własnych przekonań. Pełna napięcia, akcji i dramatycznych wyborów, bitwa o Unato przyniesie im nowe wyzwania i zmusi do zmierzenia się z ciemnością wewnątrz nich samych.
