Riki Naoe i jego przyjaciele z Klubu Little Busters kontynuują swoją przygodę, starając się jak najlepiej wykorzystać szkolną codzienność i zachować silne więzi przyjaźni. Jednak sprawy stopniowo nabierają bardziej dramatycznego charakteru, gdy grupa zaczyna mierzyć się z tajemniczymi wydarzeniami. Riki, kwestując swoją siłę i determinację, musi odkryć bolesną prawdę spajającą ich wspólne dni, a także stawić czoła swoim najgłębszym lękom.
Pełen emocji, sentymentalnego ciepła, ale i melancholijnej atmosfery, „Little Busters! Refrain” skupia się na znaczeniu przyjaźni, straty oraz dojrzewania w obliczu życiowych wyzwań. Riki musi odnaleźć swoją własną drogę, jednocześnie chroniąc więź, która zbudowała fundament dla całej grupy.
