Po wydarzeniach pierwszego sezonu „Log Horizon”, tysiące graczy nadal próbują przystosować się do codzienności nowego życia w wirtualnym świecie popularnej gry MMORPG Elder Tale. Shiroe, doświadczony strateg i lider gildii Log Horizon, wraz z przyjaciółmi, Naotsugu, Akatsuki oraz innymi mieszkańcami miasta Akihabara, mierzą się z narastającymi społecznymi i politycznymi konfliktami, jakie przynosi rzeczywistość życia wewnątrz gry.
Główny bohater Shiroe stara się zapewnić stabilność wewnętrzną społeczności graczy, równocześnie poszukując odpowiedzi na najważniejsze pytania dotyczące natury tego świata i możliwości powrotu do domu. Drugi sezon kładzie szczególny nacisk na rozwój osobisty oraz dramaty, z jakimi borykają się bohaterowie, nie tracąc przy tym lekkości, ciepłego humoru i klimatu typowego dla serii „Log Horizon”.
